Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLPPQ16740 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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