Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms