Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SSX1Q16384 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SSX1Q16384 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms