Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RYR3Q15413 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RYR3Q15413 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RYR3Q15413 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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RYR3Q15413 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RYR3Q15413 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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