Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRAM2Q15035 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAM2Q15035 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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