Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC10A1Q14973 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC10A1Q14973 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms