Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSPNQ14714 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms