Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDAC1Q13547 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC1Q13547 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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