Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ATRQ13535 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ATRQ13535 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ATRQ13535 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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