Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKP2Q13309 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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