Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RIGQ13278 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
RIGQ13278 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RIGQ13278 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RIGQ13278 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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