Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RLFQ13129 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RLFQ13129 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RLFQ13129 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RLFQ13129 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms