Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHAF1BQ13112 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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