Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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FOXF1Q12946 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FOXF1Q12946 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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