Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CNTN1Q12860 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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