Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM27E3Q08E93 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms