Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNP2Q05952 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms