Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPTBN1Q01082 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms