Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1BQ00975 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA1BQ00975 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms