Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXC5Q00444 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms