Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HERVK_113P63132 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HERVK_113P63132 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms