Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SH3BGRP55822 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3BGRP55822 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms