Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFNA3P52797 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFNA3P52797 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms