Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC4A3P48751 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC4A3P48751 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms