Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTDSS1P48651 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms