Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ACADSBP45954 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ACADSBP45954 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms