Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LTBRP36941 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LTBRP36941 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LTBRP36941 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms