Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHRNA7P36544 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms