Protein–RNA interactions for Protein: P35367

HRH1, Histamine H1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRH1P35367 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HRH1P35367 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRH1P35367 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRH1P35367 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRH1P35367 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRH1P35367 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HRH1P35367 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HRH1P35367 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HRH1P35367 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HRH1P35367 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms