Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRABP1P29762 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms