Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PTPREP23469 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PTPREP23469 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPREP23469 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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