Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF3P18847 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF3P18847 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATF3P18847 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATF3P18847 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF3P18847 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF3P18847 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms