Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACTN1P12814 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms