Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLBP1P12271 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms