Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMIM10L2BP0DMW5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms