Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.33■■□□□ 1
VIL1P09327 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
VIL1P09327 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VIL1P09327 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VIL1P09327 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VIL1P09327 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VIL1P09327 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VIL1P09327 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms