Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F13BP05160 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F13BP05160 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F13BP05160 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
F13BP05160 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms