Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPTA1P02549 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPTA1P02549 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms