Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNQ2O43526 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ2O43526 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms