Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ARPC1BO15143 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms