Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGPD8O14715 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RGPD8O14715 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms