Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F3O00716 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F3O00716 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F3O00716 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F3O00716 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F3O00716 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E2F3O00716 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F3O00716 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F3O00716 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F3O00716 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms