Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARID3CA6NKF2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3CA6NKF2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms