Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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