Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD2APQ9Y5K6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms