Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NRXN3Q9Y4C0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms