Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIF3AQ9Y496 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIF3AQ9Y496 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms