Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms