Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FBXO3Q9UK99 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FBXO3Q9UK99 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms