Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RIMS3Q9UJD0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms